Kolonoskopi tidak dianjurkan untuk pasien dengan kondisi penyakit tertentu seperti perforasi usus, peritonitis, penderita perlengketan usus, dan status kehamilan. Kolonoskopi adalah metode pemeriksaan di mana kolonoskop dimasukkan ke dalam ileum melalui anus, mengikuti saluran usus, dan lesi kolon diamati dari sisi mukosa. Kolonoskopi tidak dianjurkan untuk pasien dengan kondisi penyakit tertentu, seperti perforasi usus, peritonitis, setelah beberapa kali operasi jantung terbuka, pasien dengan perlekatan usus, obstruksi usus, syok, status kehamilan, penyakit radang usus besar stadium akut, aneurisma aorta abdominalis, demam tinggi, nyeri perut parah, gangguan jantung, paru, ginjal, hati, dan kejiwaan yang parah, serta pasien yang tidak memiliki persiapan usus yang memadai. Jika ada ketidaknyamanan pencernaan, disarankan untuk mencari perawatan medis tepat waktu dan di bawah bimbingan dokter profesional, dan tidak sembarangan menanganinya sendiri, yang dapat menyebabkan konsekuensi yang merugikan.