Kolesterol HDL dan kolesterol LDL memiliki mekanisme kerja yang berlawanan terhadap kolesterol. LDL bertanggung jawab untuk mengangkut kolesterol dari hati ke bagian luar hati, sedangkan HDL melakukan hal yang sebaliknya dan bertanggung jawab untuk mengangkut kolesterol dari bagian luar hati ke bagian dalam hati untuk metabolisme.
Kolesterol HDL yang lebih rendah mencegah kolesterol ekstrahepatik diangkut ke hati pada waktu yang tepat, sehingga mengakibatkan kadar kolesterol yang lebih tinggi dalam darah, yang paling sering terjadi pada pasien yang menderita aterosklerosis, sindrom nefrotik, dan diabetes melitus.
Peningkatan kolesterol LDL adalah penyebab utama hiperkolesterolemia, yang berkorelasi positif dengan perkembangan penyakit jantung koroner dan dapat digunakan untuk menentukan risiko penyakit jantung koroner; hal ini juga dapat dilihat pada pasien yang menderita sindrom nefrotik, hipotiroidisme, hiperlipoproteinemia turunan, ikterus kolestatik, dan obesitas.
HDL yang rendah dan LDL yang tinggi menunjukkan bahwa pasien memiliki metabolisme lipid yang tidak normal, dan disarankan agar pasien dievaluasi di rumah sakit secara teratur untuk menghindari keterlambatan.