Pemeriksaan resonansi magnetik umumnya tidak menyebabkan radiasi pada tubuh manusia, tetapi penggunaan pemeriksaan resonansi magnetik harus dikontraindikasikan untuk pemasangan stent, alat pacu jantung, atau benda asing logam di dalam tubuh. Medan magnet yang digunakan dalam pemeriksaan resonansi magnetik adalah medan magnet terapan, yang tidak memiliki efek radiasi pada tubuh manusia dan tidak akan menyebabkan kerusakan serius pada tubuh. Ketika tubuh manusia menjalani pemeriksaan resonansi magnetik, perangkat logam harus dilepaskan dari tubuh untuk menghindari reaksi elektromagnetik selama pemeriksaan. Karena pemeriksaan resonansi magnetik dilakukan di ruang yang relatif tertutup, ruangnya relatif kecil dan waktu pemeriksaan akan relatif lama, oleh karena itu, bagi pasien dengan klaustrofobia, proses pemeriksaan akan menyebabkan beberapa rangsangan mental, menimbulkan rasa takut dan tampak memiliki detak jantung yang cepat. Selain itu, ketika melakukan pemeriksaan resonansi magnetik, harus dipersiapkan dengan baik secara psikologis, bagi tubuh yang memasang stent atau alat pacu jantung, serta wanita hamil dan orang lain harus berhati-hati untuk menggunakan pemeriksaan resonansi magnetik.