Nyeri alat kelamin pada bayi dapat disebabkan oleh trauma, atau oleh penyakit seperti kulup yang tumbuh ke dalam pada bayi laki-laki atau vulvovaginitis pada anak perempuan. 1. Trauma: Jika alat kelamin bayi baru saja mengalami cedera himpitan atau cedera tekanan, diikuti dengan rasa sakit yang terlokalisasi. 2. Kulup tumbuh ke dalam pada bayi laki-laki: penyebab dasar penyakit ini adalah adanya cincin sempit pada pembukaan kulup, untuk bayi dan anak kecil, terutama karena pencucian penis yang tidak tepat, gejala utamanya adalah nyeri, pembengkakan dan kemacetan pada kepala penis, dll., sehingga anak laki-laki dengan nyeri genital perlu mempertimbangkan bahwa hal tersebut mungkin disebabkan oleh kulup yang tumbuh ke dalam. 3. Vulvovaginitis pada anak perempuan muda: terkait dengan resistensi vagina yang buruk pada bayi dan anak kecil, vulva belum berkembang, menggaruk dengan tangan kotor dan faktor lainnya, gejala khasnya adalah gatal-gatal pada vulva, keluarnya nanah dari vagina, dan terkadang ada sedikit rasa sakit, yang dapat bermanifestasi sebagai nyeri kelamin pada anak-anak. Nyeri genital bayi, mungkin juga ada alasan lain, disarankan untuk pergi ke rumah sakit tepat waktu, meningkatkan pemeriksaan untuk memperjelas penyebab penyakit, di bawah bimbingan dokter untuk memberikan perawatan atau perawatan yang ditargetkan.