Jika pasien datang dengan gejala gastrointestinal yang tidak dapat didiagnosis dengan fluoroskopi sinar-X, CT abdomen dapat dilakukan untuk memeriksa perubahan abnormal seperti obstruksi usus, tumor usus, torsio usus atau perlengketan, dan cairan dalam rongga perut. Jika terdapat kelainan, pemeriksaan abdomen lebih lanjut dapat dilakukan untuk meningkatkan akurasi diagnosis penyakit. CT abdomen memiliki keunggulan unik untuk pemeriksaan dan diagnosis perforasi usus. Perforasi usus umumnya dapat didiagnosis dengan radiologi umum, CT lebih tipis dan dapat mengamati gas yang lebih kecil, jika usus menyebarkan lebih sedikit gas setelah perforasi, CT diperlukan untuk mengkonfirmasi diagnosis. CT tipis dapat meningkatkan akurasi diagnostik perforasi gastrointestinal.