Metode yang berbeda seperti reseksi terbuka, reseksi akar atau ujung, pengangkatan kapsul internal dan debridemen kapsul eksternal dapat dipilih sesuai dengan ukuran kista hati yang berbeda serta gejalanya. Dalam kasus kista hati sederhana yang besar dengan gejala, selain tusukan dan aspirasi, pembukaan atau pemenggalan laparoskopi, cairan intrakapsular juga dapat disedot melalui operasi caesar, dan dinding kista dapat dinonaktifkan dengan alkohol atau reseksi terbuka ke rongga perut dengan pisau argon. Kista yang terletak di pinggiran hati atau menonjol ke dalam rongga perut dengan ujungnya, dapat langsung dijepit dari akar atau ujungnya, kistektomi, operasinya relatif sederhana. Ada dua cara untuk kista yang dienkapsulasi hati: pengangkatan kapsul internal dan pengelupasan kapsul eksternal secara menyeluruh, yang keduanya harus disterilkan dengan agen benzimidazol sebelum operasi. Tindakan yang pertama tidak terlalu invasif, dengan komplikasi seperti fistula bilier residual, kekambuhan dan implantasi diseminata; tindakan yang kedua menghindari tumpahan cairan kistik dan fistula bilier pasca operasi. Pasien dengan kista hati harus ditinjau dan diatur untuk mencari bantuan medis ketika pembedahan diperlukan untuk meminimalkan risiko dan komplikasi.