Menstruasi berhubungan dengan rahim wanita dan permulaan menstruasi adalah luruhnya lapisan rahim. Jika lapisan rahim lebih tebal, menstruasi akan lebih sering terjadi dan sebaliknya. Endometrium diatur oleh hormon yang diproduksi oleh indung telur, terutama estrogen, yang mendorong endometrium untuk tumbuh. Oleh karena itu, jika kadar estrogen tinggi, endometrium akan menebal dan sebaliknya. Jika rahim mengalami gangguan, hal ini juga dapat menyebabkan menstruasi yang berat atau ringan, misalnya, pasien dengan fibroid rahim atau adenomiosis dapat mengalami menstruasi yang berat dan menstruasi yang berkepanjangan. Endometrium juga diatur oleh hormon yang diproduksi oleh ovarium dan kadang-kadang hormon lain dapat mempengaruhi endometrium, misalnya, pasien dengan sindrom ovarium polikistik dapat mengalami aliran menstruasi yang rendah.