Kista hati saat ini tidak dapat diatasi dengan pengobatan saja, tetapi dapat diobati dengan pengobatan sebagai tambahan.
Pengobatan farmakologis untuk kista hati terutama untuk sistiserkosis hati kistik, sebagai pengobatan tambahan selain pembedahan. Obat anti-kista yang umum digunakan terutama meliputi mebendazol, albendazol, benzimidazol, dan sebagainya.
Untuk pasien dengan kista yang mengalami komplikasi infeksi bakteri mungkin mengalami demam tinggi, sakit perut, peningkatan sel darah putih dan gejala lainnya, antibiotik dapat digunakan untuk pengobatan, dan obat anti infeksi yang umum digunakan termasuk levofloxacin, moxifloxacin dan sebagainya.
Kista hati biasanya diobati dengan pembedahan. Metode pembedahan yang umum digunakan meliputi pembukaan kista, hepatektomi parsial, pengelupasan kista hati secara menyeluruh, dan sebagainya. Pasien dapat memilih rencana pengobatan yang sesuai dengan saran dokter.
Pasien dengan kista hati biasanya tidak memerlukan pengobatan khusus jika tidak memiliki gejala yang jelas, dan pemeriksaan lanjutan secara teratur sudah cukup. Pasien dengan kista yang besar dan memiliki gejala perlu dirawat di bawah bimbingan dokter.