Penyebab pasti atresia esofagus belum sepenuhnya dipahami dan mungkin terkait dengan teratogen lingkungan, gen, dan faktor lainnya.
Atresia esofagus mengacu pada gangguan bawaan pada kerongkongan. Mungkin terdapat beberapa fistula di antara kerongkongan yang mengalami kelainan bentuk dan trakea, sehingga makanan tidak dapat melewati kerongkongan menuju saluran cerna. Atresia esofagus merupakan cacat perkembangan kerongkongan bawaan, dan dapat disebabkan oleh penggunaan pil KB yang berkepanjangan oleh ibu, paparan estrogen atau teratogen selama kehamilan, penggunaan obat tidur, atau cacat genetik.
Anak-anak dapat dilahirkan dengan gejala-gejala seperti tersedak, gangguan pernapasan, ketidakmampuan untuk makan, dan mulut berbusa, dll. Sebagian besar anak-anak dengan atresia esofagus memiliki tingkat kelangsungan hidup jangka panjang dengan perawatan yang tepat.
Keluarga dari anak-anak dengan atresia esofagus dapat berkonsultasi dengan bagian neonatologi atau bagian lain yang relevan di rumah sakit umum.