Lamanya kolonoskopi bervariasi dan dipengaruhi oleh sejumlah faktor. Dalam kasus yang singkat, kolonoskopi dapat diselesaikan dalam waktu sekitar 10 menit, sedangkan dalam kasus yang lama, dapat memakan waktu setengah jam atau bahkan satu jam. Beberapa pasien mungkin tidak dapat menyelesaikan prosedur ini dengan baik. Faktor-faktor yang mempengaruhi hal ini adalah sebagai berikut: Pertama, saluran usus pasien. Beberapa pasien memiliki sedikit lengkungan pada usus mereka dan dapat melakukannya dengan lancar, sementara yang lain memiliki usus yang kasar dan sulit untuk melakukannya. Poin kedua adalah tingkat toleransi pasien. Beberapa pasien tidak dapat mentoleransi rasa sakit dari kolonoskopi dan mengalami kesulitan untuk melakukannya. Poin ketiga adalah keterampilan dokter kolonoskopi. Jika Anda tidak cukup terampil, kolonoskopi akan berjalan sangat lambat. Poin terakhir adalah durasi kolonoskopi juga dipengaruhi oleh ada atau tidaknya operasi lain, seperti pengobatan polip di bawah kolonoskopi.