Sebagian besar epilepsi yang disebabkan oleh ensefalitis virus tidak serius, dan beberapa dapat berkembang menjadi epilepsi persisten, yang dapat menjadi lebih parah.
Bentuk ensefalitis virus yang lebih umum adalah ensefalitis virus herpes simpleks. Sebagian besar ensefalitis memiliki perjalanan penyakit tertentu, diagnosis tepat waktu dan pengobatan aktif, biasanya dapat disembuhkan, tidak akan meninggalkan gejala sisa, kondisi yang disebabkan oleh epilepsi ini tidak serius, gejala epilepsi akan hilang setelah penyakitnya sembuh.
Beberapa ensefalitis virus berkembang lebih cepat, dengan rasa kantuk, lesu, koma atau keadaan dekortikasi dalam waktu singkat atau bahkan pada tahap awal, yang menyebabkan nekrosis parenkim otak yang luas dan edema serebral. Kerusakan jaringan otak pada jenis ensefalitis virus ini parah, tidak mudah untuk dipulihkan, dan akan meninggalkan efek samping, seperti epilepsi yang menetap.
Diagnosis ensefalitis virus harus ditangani secara agresif, dan kepatuhan yang ketat terhadap nasihat medis dapat memperpendek durasi penyakit, mengurangi gejala, meningkatkan tingkat kesembuhan, dan mengurangi konsekuensi yang merugikan dari penyakit ini.