Obat yang ditargetkan untuk kanker esofagus termasuk trastuzumab, erlotinib, bevacizumab, dan sebagainya. Trastuzumab terutama digunakan untuk pengobatan lini pertama pasien adenokarsinoma esofagus stadium lanjut dengan ekspresi mutasi gen HER-2 yang tinggi, dan umumnya perlu dikombinasikan dengan kemoterapi dalam penggunaan klinis. Anrotinib dan bevacizumab adalah obat bertarget yang menghambat neoangiogenesis tumor pada kanker esofagus. Kedua obat bertarget ini tidak memerlukan pengujian genetik sebelum pemberian dan umumnya digunakan dalam pengobatan lini belakang untuk kanker esofagus stadium lanjut. Umumnya, setelah kemoterapi lini pertama dan kedua serta terapi bertarget, jika kondisi kanker esofagus berkembang lagi, seseorang dapat mempertimbangkan untuk memilih monoterapi anilotinib, atau memilih rencana pengobatan bevacizumab yang dikombinasikan dengan kemoterapi. Semua obat yang ditargetkan di atas memiliki efek samping, dan efek samping yang umum terjadi adalah ruam, kardiotoksisitas, tekanan darah tinggi, proteinuria, dan sebagainya, yang perlu dipandu oleh dokter profesional.