Penanganan kista selubung tendon tergantung pada kondisinya. Jika kondisinya ringan, kista ini akan berangsur-angsur menyusut atau menjadi lebih lunak setelah beristirahat, atau bahkan menghilang dengan sendirinya, dan biasanya ditangani secara konservatif. Jika kondisinya serius, diperlukan pembedahan. Sebagian besar pasien kista selubung tendon dengan peningkatan aktivitas, akan terjadi fenomena pembesaran kista, disertai rasa nyeri atau fenomena pembengkakan lokal, tetapi setelah istirahat yang cukup, dapat mengurangi volume kista, kista secara bertahap akan menyusut atau melunak, dan dalam beberapa kasus, akan menghilang dengan sendirinya, sehingga pengobatan konservatif secara umum. Secara klinis, jika kista selubung tendon berukuran besar dan tidak kunjung mengecil, memiliki tingkat kekambuhan yang tinggi, serta mempengaruhi penampilan atau fungsi, maka diperlukan reseksi bedah. Jika didiagnosis dengan kista selubung tendon, disarankan agar pasien melakukan tindakan pengondisian diri dengan baik, terutama memperhatikan untuk menghindari olahraga berat, melindungi persendian, dan pergi ke rumah sakit untuk diagnosis dan pengobatan tepat waktu jika ada kelainan.