Kolonoskopi biasanya tidak dilakukan pada hari yang sama dan perlu dilakukan setelah melalui proses pemesanan janji temu serta pembersihan usus terlebih dahulu. Pembersihan usus biasanya diperlukan untuk membuang semua kotoran dari tubuh sebelum kolonoskopi dilakukan. Hal ini biasanya dilakukan di bawah pengawasan dokter dengan menggunakan obat pencahar, seperti elektrolit polietilen glikol atau magnesium sulfat atau manitol, untuk membersihkan usus dan membuang sebagian bahan feses dari usus sebelum tes dilakukan. Dibutuhkan waktu yang lebih lama untuk mempersiapkannya dan biasanya kecil kemungkinannya untuk dilakukan pada hari yang sama. Oleh karena itu, disarankan untuk membuat janji temu di rumah sakit pada saat Anda sedang tidak enak badan, dan melakukan persiapan penuh di bawah bimbingan dokter sesuai dengan situasi Anda yang sebenarnya untuk memaksimalkan keakuratan pemeriksaan.