Perbedaan utama antara IVF generasi kedua dan generasi ketiga adalah aplikasi populasi yang berbeda, IVF generasi kedua terutama untuk pasien dengan oligozoospermia berat, spermatozoa lemah, teratospermia atau azoospermia pada pasangan pria, dan IVF generasi ketiga terutama diterapkan pada pasien dengan penyakit gen tunggal pada pasangan. IVF generasi kedua terutama membantu jenis pasien berikut ini untuk hamil, seperti oligozoospermia parah, spermatozoa lemah dan teratogenesis, dll. Untuk pasien yang perlu menjalani pengujian genetika embrio pra-implantasi, operasi spesifiknya adalah memilih air mani. Setelah optimasi air mani, sperma dengan penampilan normal dan vitalitas yang baik akan dipilih dan ditambahkan langsung ke sel telur untuk menyelesaikan seluruh proses pembuahan. IVF generasi ketiga harus terlebih dahulu melakukan pemeriksaan kromosom embrio pada semua embrio yang dinilai baik sebelum pemindahan embrio, dan menyaring embrio dengan pemeriksaan kromosom yang normal, lalu melakukan pemindahan. IVF generasi ketiga adalah metode pembuahan berbantuan yang digunakan untuk mencegah penularan penyakit keturunan ke generasi berikutnya, untuk mencegah salah satu atau kedua pasangan pasien mengembangkan penyakit keturunan keluarga. IVF generasi kedua dan ketiga memiliki kelebihan masing-masing dan rencana perawatan terbaik harus dilakukan di bawah nasihat dokter.