Fistula anus dan kolonoskopi tidak dapat dilakukan bersamaan; karena fistula anus sendiri disebabkan oleh infeksi bakteri, dan selama kolonoskopi, bakteri dapat terbawa ke dalam usus, sehingga menyebabkan radang rektum atau usus besar. Kolonoskopi adalah metode skrining, dan kolonoskopi tanpa rasa sakit dapat dilakukan dengan anestesi. Kolonoskopi terutama digunakan untuk memeriksa penyakit pada rektum dan usus besar. Penyakit yang diperiksa terutama radang usus, polip usus, konstipasi usus besar, kanker usus besar, kanker rektum dan penyakit lainnya. Namun, fistula anus berbeda, fistula anus adalah penyakit yang disebabkan oleh abses perianal, yang tidak dapat diatasi dengan kolonoskopi dan harus diobati melalui pembedahan dengan anestesi. Pembedahan ini melibatkan pemotongan fistula internal dan kemudian membuang semua jaringan nekrotik, yang merupakan operasi aseptik dan tidak dapat dilakukan bersamaan dengan kolonoskopi. Pasien harus pergi ke rumah sakit untuk pemeriksaan jika mereka memiliki gejala yang tidak nyaman, dan mengikuti instruksi dokter untuk memberikan diagnosis dan pengobatan yang relevan, untuk menghindari keterlambatan dalam kondisi ini.