Tidak semua menstruasi yang tertunda atau terhenti akan terjadi setelah menggunakan progesteron. Jika seorang wanita mengalami keterlambatan menstruasi dan tidak mengalami menstruasi setelah 7 hari penghentian penggunaan progesteron, pertama-tama ia harus menjalani USG ginekologi untuk mengamati ketebalan lapisan endometrium rahim. Jika ketebalan endometrium lebih dari 1,0 cm, tetapi tidak ada menstruasi, pertimbangan utamanya adalah bahwa hal itu mungkin disebabkan oleh kehamilan atau perlekatan endometrium atau perlekatan saluran serviks, dan diperlukan pemeriksaan lebih lanjut. Jika tidak ada menstruasi setelah 7 hari penghentian progesteron, tetapi USG menunjukkan bahwa endometrium relatif tipis, maka dianggap mungkin ada kerusakan endometrium, adhesi setelah kerusakan endometrium, kegagalan ovarium, atau lesi pada hipotalamus atau kelenjar hipofisis, yang mengakibatkan sekresi hormon yang tidak normal. Karena wanita harus memiliki dosis estrogen tertentu agar progesteron dapat bekerja, maka jika estrogen sangat rendah atau tidak ada, progesteron tidak akan bekerja.