Suplementasi protein nabati lebih disukai pada pasien dengan ensefalopati hepatik dan jumlah suplementasi protein bervariasi tergantung pada tingkat keparahan penyakit. Protein nabati kaya akan asam amino rantai cabang, serat yang tidak dapat diserap, dan dapat meningkatkan eliminasi amonia setelah fermentasi dan produksi asam oleh bakteri usus. Untuk ensefalopati hepatik akut, protein harus dilarang selama beberapa hari, dan harus dibatasi kurang dari 20g per hari jika itu adalah ensefalopati hepatik stadium 1 ~ 2 untuk menghindari kejengkelan penyakit. Ketika pasien pulih dari bangun tidur, jumlah asupan protein harus secara bertahap ditingkatkan dari 20g per hari menjadi 1g per kg berat badan pasien per hari (misalnya, jika berat badannya 60kg, jumlah asupan protein harus 60g per hari). Pasien dengan ensefalopati hepatik kronis umumnya tidak memerlukan suplementasi protein. Selain itu, mereka harus diberi asupan kalori yang cukup, berbagai vitamin, dan plasma atau albumin yang sesuai.