Gejala utama usus berlubang adalah timbulnya rasa sakit yang parah dan terus-menerus di perut secara tiba-tiba, sering kali di perut bagian atas pada kasus ulkus duodenum berlubang. Pada kasus perforasi lainnya, rasa sakit dapat paling terasa di lokasi utama dan dapat dengan cepat menyebar ke seluruh perut, meningkat dengan bernapas dalam-dalam, batuk, atau berbalik. Selain itu, dapat terjadi refleks mual dan muntah, terutama karena iritasi pada peritoneum, dengan muntahan yang merupakan isi perut. Jika berlubang, hal ini dapat menyebabkan peritonitis difus akut. Peritonitis difus akut dapat muncul dengan tampilan kritis akut dan tiga serangkai khas peritonitis, termasuk nyeri tekan, nyeri pantul, dan ketegangan otot di perut.