Efek samping yang paling serius dari metformin terutama adalah asidosis laktat yang relatif jarang terjadi. Penggunaan metformin dalam jangka panjang dapat mengurangi penyerapan vitamin B12 dan hal ini harus dipertimbangkan jika pasien mengalami anemia megaloblastik, tetapi hal ini pada umumnya sangat jarang terjadi. Reaksi merugikan yang umum terjadi terutama pada pencernaan, seperti mual, muntah, diare, sakit perut dan kehilangan nafsu makan, dan sebagian besar pasien dapat sembuh sendiri dengan menghentikan pemberian obat. Obat ini juga memiliki efek samping yang umum terjadi, seperti gangguan pengecapan dan kelainan pada saluran cerna. Selain itu, akan ada beberapa yang jarang terjadi seperti kelainan jaringan subkutan, reaksi kulit seperti urtikaria, eritema, gatal-gatal, dll. Oleh karena itu, Anda harus membaca petunjuk sebelum menggunakan obat dan memahami sepenuhnya obat sebelum mulai menggunakannya untuk menghindari reaksi yang tidak dapat ditoleransi, tetapi konsultasikan dengan apoteker atau pergi ke rumah sakit jika terjadi reaksi dan gejala yang tidak dapat ditoleransi.