Histeroskopi dapat menyebabkan kerusakan pada tubuh, tetapi kerusakannya sangat minimal karena ini bukan operasi pembedahan. Ada dua area utama bahaya dari histeroskopi: 1. Dapat menyebabkan infeksi pada rongga rahim. Akses histeroskopi adalah dari bawah ke atas, dari area yang terinfeksi ke area yang steril. Jika pasien mengalami peradangan pada vagina, maka akan mudah membawa peradangan ke dalam rongga rahim selama operasi, sehingga menyebabkan infeksi pada rongga rahim atau rongga panggul. Inilah sebabnya mengapa penting bagi wanita untuk melakukan tes keputihan sebelum menjalani histeroskopi, dan jika mereka mengalami peradangan, mereka perlu diobati sebelum menjalani histeroskopi. 2. Rahim rentan terhadap perforasi. Jika pasien mengalami perkembangan abnormal pada serviks atau perlengketan di rongga rahim, saat melakukan histeroskopi, probe pemeriksaan tidak dapat masuk ke rongga rahim melalui saluran normal, dan saat bertemu dengan penghalang miometrium, jika pemeriksa menggunakan tenaga yang berlebihan, maka akan mudah menembus miometrium dan terjadi perforasi.