Ukuran kista poplitea bukan merupakan indikasi mutlak untuk pembedahan, dan kista poplitea yang tidak bergejala biasanya tidak memerlukan perawatan bedah.
Umumnya, bila kista poplitea tumbuh lebih dari 2 cm, kista ini dapat menekan jaringan di sekitarnya dan menyebabkan nyeri lokal atau menekan saraf di bagian belakang dan menyebabkan mati rasa pada tungkai bawah, atau dapat menyebabkan pergerakan sendi lutut akibat peningkatan ukuran kista poplitea. Dalam hal ini, kista perlu diangkat.
Metode pengangkatan kista meliputi sayatan dan eksisi tradisional, dan pengangkatan lutut secara artroskopi, di mana kista ditemukan, cairan kista dikeringkan dari bagian dalam kista, dan dinding kista diangkat, dan daerah posterior lutut dibalut dengan tekanan setelah operasi untuk mencegah kambuhnya kista.
Pembedahan dapat dipertimbangkan untuk kista poplitea yang berukuran lebih dari 2 cm dan berdampak pada pekerjaan dan kehidupan.
Pembedahan untuk kista poplitea direkomendasikan untuk dilakukan di rumah sakit biasa.