Antibodi anti-nuklir yang positif biasanya mengindikasikan adanya gangguan kekebalan tubuh seperti penyakit jaringan ikat, tetapi diagnosis yang tepat akan bergantung pada gejala Anda dan profil antibodi anti-nuklir yang lengkap untuk melihat indikator antibodi spesifik mana yang positif. Sebagai contoh, antibodi anti-SM atau antibodi DNA untai ganda yang positif dalam profil antibodi anti-nuklir menunjukkan adanya SLE. Penting untuk dicatat bahwa pada beberapa orang normal, terutama mereka yang berusia di atas 60 tahun, antibodi antinuklear positif sederhana juga dapat terjadi. Ada juga penyakit neoplastik, tuberkulosis dan penyakit ginjal yang dapat menunjukkan antibodi antinuklear yang positif dan memerlukan pemeriksaan lebih lanjut untuk mengklarifikasi kondisinya. Jika semua antibodi lain dalam profil antibodi antinuklear negatif, tidak ada kelainan pada komplemen, protein C-reaktif atau sedimentasi darah, tidak ada gejala fisik, dan tumor atau TBC telah disingkirkan, antibodi antinuklear dapat diperiksa ulang secara teratur.