Untuk kardiomiopati obstruktif hipertrofik, yang menjadi lebih umum dengan peningkatan metode skrining, pengobatan untuk penyakit ini terutama adalah sebagai berikut: 1. Terapi obat: dengan menggunakan obat untuk memperlambat denyut jantung, periode diastolik pasien diperpanjang dan gejala obstruktif diredakan. Obat CCB, seperti diltiazem atau isobodine, juga dapat digunakan untuk mengontrol denyut jantung. 2. Terapi ablasi kimiawi: Terapi ini adalah pengobatan intervensi di mana pembuluh darah yang terkait dengan otot jantung hipertrofik diablasi secara kimiawi dengan cara intervensi, yaitu ablasi alkohol. Melalui cara buatan ini, nekrosis miokardium yang disebabkan oleh penyumbatan pembuluh darah dapat secara perlahan-lahan mengalami atrofi untuk mengurangi gejala obstruktif pasien; 3. Reseksi bedah: relatif invasif dan berisiko, tetapi hasil pengobatan pasien sangat memuaskan dan sangat tepat; 4. Terapi alat: Pasien kardiomiopati hipertrofi obstruktif yang mengalami sinkop atau aritmia gabungan dapat diobati dengan alat pacu jantung.