Perawatan utama untuk foramen ovale paten bawaan adalah pembedahan. Ada dua pilihan pembedahan: perbaikan tradisional foramen ovale paten dan penutupan invasif minimal. Operasi perbaikan bisa berupa pembukaan anterior sternum melalui bagian depan dada atau pembukaan lateral dada di antara dua tulang rusuk. Ada juga dua jenis prosedur oklusi, salah satunya dilakukan di bawah sinar-x melalui kanula vena femoralis. Yang lainnya adalah sayatan kecil di dada yang dipandu oleh ultrasonografi esofagus. Jenis yang pertama dilakukan setelah kardiologi dan yang lainnya dilakukan dalam bedah jantung. Tidak semua kasus foramen ovale paten perlu diobati. Jika diameter foramen ovale paten sangat kecil, tidak ada efek pada struktur jantung atau tekanan arteri pulmonalis, dan pasien tidak memiliki gejala apa pun, mungkin saja pengobatan tidak diperlukan. Oleh karena itu, kebutuhan untuk pengobatan ditentukan oleh kunjungan ke dokter bedah jantung atau kardiolog untuk menentukan apakah operasi diindikasikan dan apakah pengobatan diperlukan.