SLE adalah penyakit autoimun sistemik yang mempengaruhi banyak sistem dan organ tubuh, dan karenanya memiliki presentasi klinis yang kompleks dan bervariasi. Sebagian besar kasus SLE memiliki onset yang berbahaya dan pada awalnya mungkin muncul dengan demam ringan yang persisten, malaise, kehilangan nafsu makan, wasting, atau artritis ringan, ruam, nefritis okultisme, hipositosis, anemia ringan dan trombositopenia. Seiring perkembangan penyakit, beberapa sistem dan kerusakan organ dapat muncul secara bertahap, seperti invasi selaput lendir kulit, yang dapat dilihat sebagai eritema berbentuk kupu-kupu, fotosensitifitas, eritema nodular, ulkus mukosa mulut atau hidung, dll.; invasi rongga membran plasma, yang dapat dilihat sebagai radang selaput dada, efusi pleura, efusi peritoneum, efusi perikardial, dll.; invasi sendi dan otot, yang dapat dilihat sebagai pembengkakan sendi dan nyeri otot; invasi ginjal, yang dapat dilihat sebagai proteinuria, hematuria, oedema, hipertensi, dll.; invasi Pada sistem saraf, sakit kepala, epilepsi, gangguan suasana hati, dll.; pada sistem pencernaan, sakit perut, pembesaran hati dan limpa, kelainan fungsi hati, dll.; pada mata, kehilangan penglihatan, pendarahan fundus, edema cakram optik, dll. Pada beberapa pasien yang sakit kritis, anemia hemolitik, defisiensi granulosit, insufisiensi ginjal akut, perdarahan alveolar, pneumonia berat, abdomen akut, dan koma juga dapat terjadi, yang dapat mengancam nyawa jika tidak diobati. Gejala SLE bervariasi dan melibatkan banyak organ sistemik, dan tingkat keparahan penyakit bervariasi dari orang ke orang. Secara umum, wanita usia subur dan mereka yang memiliki riwayat keluarga lupus harus mempertimbangkan kemungkinan SLE dan mencari perhatian medis segera jika mereka mengembangkan tanda-tanda dan gejala yang melibatkan beberapa organ sistemik yang sulit dijelaskan dengan penyakit konvensional.