Penggunaan probiotik dalam jangka panjang dapat mengganggu keseimbangan flora usus seseorang, sehingga orang dewasa tidak boleh sembarangan mengonsumsi obat dalam jangka panjang, dan harus mengikuti petunjuk dokter untuk mengatur penggunaan obat.
Probiotik adalah istilah umum untuk kelas bakteri yang bermanfaat bagi tubuh manusia. Saat ini, sediaan probiotik usus paling sering digunakan dalam praktik klinis, dan obat-obatan tersebut cocok untuk mengobati sembelit dan diare yang berkaitan dengan ketidakseimbangan flora usus. Namun, sebagai obat terapeutik, probiotik perlu dihentikan setelah kondisinya terkendali, untuk menghindari asupan bakteri asing dalam jumlah besar dalam jangka panjang, yang dapat menghambat pembentukan keseimbangan flora usus sendiri.
Selain itu, perlu dicatat bahwa kontraindikasi sediaan probiotik belum jelas, dan mungkin ada ruam, perut kembung, dan reaksi merugikan lainnya selama penggunaan obat. Oleh karena itu, mereka yang memiliki kebutuhan untuk menggunakan obat jenis ini harus di bawah bimbingan dokter untuk mengatur dosis dan siklus terapeutik, tidak membabi buta menggunakan obat jangka panjang, agar tidak menimbulkan konsekuensi yang merugikan.