Pembedahan untuk fistula ani kompleks tinggi kemungkinan besar tidak dapat dilakukan dengan benar dalam satu episode. Kemungkinan untuk melakukannya dengan benar dalam satu episode lebih kecil dibandingkan dengan fistula ani sederhana, dan prognosis yang lebih baik dapat dicapai melalui perawatan bedah bertahap atau terbagi. Fistula anal kompleks yang tinggi dapat membentuk beberapa fistula dibandingkan dengan fistula anal sederhana, dan pada setiap episode, banyak tabung cabang yang lebih kecil dapat terbentuk. Saat melakukan pemeriksaan, mungkin tidak dapat sepenuhnya memeriksa atau memeriksa dengan jelas, dan kemungkinan besar beberapa tabung cabang kecil akan terlewatkan selama operasi, dan mungkin tidak dapat melakukan pekerjaan dengan baik pada satu waktu. Namun, jika ahli bedah lebih berpengalaman dan mahir secara teknis, ia akan dapat memeriksa semua fistula sekaligus, dan menutupi semua fistula sekaligus selama operasi untuk perawatan saluran akar, dan tingkat keberhasilan operasi akan sangat meningkat. Jika tidak ada keberhasilan satu kali, maka dapat diobati dengan operasi terpisah dan bertahap. Karena kompleksitas fistula anus tingkat tinggi lebih rumit, disarankan untuk pergi ke rumah sakit biasa tepat waktu, memilih perawatan bedah dokter profesional, mengikuti instruksi dokter dan secara aktif bekerja sama, sesuai dengan kondisi perawatan bedah yang diperlukan lagi.