Alergi makanan adalah reaksi abnormal yang disebabkan oleh protein dalam makanan karena sistem pencernaan dan kekebalan tubuh bayi belum berkembang dengan baik. Setelah bayi didiagnosis dengan alergi protein susu, susu dan produk susu harus dihindari sepenuhnya. Jika bayi disusui, ibu harus benar-benar menghindari susu dan produk susu. Hal ini tergantung pada seberapa baik alerginya sembuh. Jika sembuh dengan baik dan pertumbuhan bayi tidak terpengaruh, ibu dapat terus menyusui, tetapi ia harus memperhatikan suplementasi kalsium. Jika gejalanya tidak berkurang dengan baik dan pertumbuhan dan perkembangannya terpengaruh, yang terbaik adalah menggunakan susu formula hipoalergenik khusus untuk intervensi dini. Jika bayi diberi makanan campuran atau susu formula, ibu harus berpantang makan, dan pada saat yang sama susu bubuk bayi harus diganti dengan susu formula hipoalergenik khusus. Hal ini karena begitu alergi terdiagnosis, alergi harus diobati sesegera mungkin. Jika dibiarkan dalam waktu yang lama, anak akan mengalami alergi pernapasan, seperti rinitis alergi dan asma, saat ia dewasa. Oleh karena itu, bagi bayi yang alergi susu, selain menghindari susu dan produk susu secara ketat, sebaiknya memilih susu formula bernutrisi lengkap yang dapat menggantikan susu formula untuk memenuhi kebutuhan tumbuh kembangnya. Disarankan untuk memilih formula asam amino bebas 100% untuk pemberian makanan alternatif, yang terutama digunakan untuk bayi dengan alergi protein susu atau alergi protein makanan ganda.