Pendekatan bedah terhadap hiperinsulinemia kongenital juga menjadi perhatian besar bagi para orang tua. Tergantung pada jenis histologis pankreas, ada dua pilihan bedah utama untuk hiperinsulinemia kongenital: pankreatektomi parsial dan pankreatektomi subtotal. Cara pertama cocok untuk anak-anak dengan CHI fokal, di mana hanya bagian pankreas yang mengandung lesi fokal yang diangkat, dan prognosis umumnya lebih baik untuk jenis pasien ini. Pankreatektomi subtotal digunakan pada anak-anak dengan CHI difus, di mana sekitar 95-97% pankreas diangkat. Hasil dan hasil pasca operasi anak-anak dengan jenis CHI ini lebih kompleks dan pengamatan klinis jangka panjang serta tindak lanjut masih diperlukan setelah operasi.