Ensefalitis biasanya diakibatkan oleh infeksi virus atau bakteri, dengan jenis yang umum seperti BSE dan ensefalitis tuberkulosis. Pada tahap awal, pasien mungkin memiliki gejala yang mirip dengan gejala flu biasa, seperti demam dan sakit kepala, yang mungkin disertai muntah, lemas dan depresi. Gejala awal ensefalitis yang khas adalah demam dan sakit kepala, yang dapat terjadi secara bersamaan atau berurutan. Suhu tubuh pasien biasanya meningkat dengan cepat dalam 1-2 hari, sebagian besar di atas 38,5 ° C, dan mungkin di atas 40 ° C dalam kasus yang parah. Sakit kepala biasanya merupakan sakit kepala penuh yang bersifat nyeri tumpul, yang memburuk secara progresif. Pasien mungkin mengalami muntah-muntah, malaise, dan depresi bersama dengan demam dan sakit kepala, dan muntah biasanya seperti jet. Sebagian pasien dengan ensefalitis memiliki riwayat infeksi sebelumnya, seperti infeksi saluran pernapasan atas akut dan diare akut, dan seiring perkembangan penyakit, gejala seperti demam, sakit kepala dan muntah muncul 1-2 minggu kemudian. Ensefalitis lebih akut dalam onsetnya dan berkembang lebih cepat, dari ketidaknyamanan yang lebih ringan seperti sakit kepala dan demam hingga kesadaran kabur dan gangguan kesadaran, yang mungkin hanya membutuhkan waktu beberapa hari, dan kematian bahkan dapat terjadi pada kasus yang parah. Oleh karena itu, pasien disarankan untuk segera mencari nasihat medis jika mereka memiliki gejala-gejala ini untuk menghindari perkembangan penyakit.