1. Peradangan testis: Umumnya terjadi sekitar seminggu setelah gondongan, dengan demam tinggi yang tiba-tiba, menggigil, testis bengkak dan nyeri dengan nyeri tekan yang parah, edema yang signifikan pada kulit skrotum pada kasus yang parah, cairan kuning pada rongga selubung, lesi sebagian besar menyerang satu sisi, gejala akut sekitar 3 sampai 5 hari, seluruh proses sekitar 10 hari. Jarang sekali menyebabkan kemandulan. 2. Ovarianitis: Manifestasi utamanya adalah menggigil dan demam mendadak, nyeri pada perut bagian bawah atau daerah lumbosakral, gangguan siklus menstruasi, dan pada kasus yang parah, pembesaran indung telur yang teraba dengan nyeri tekan. Hal ini tidak mempengaruhi kesuburan. 3. Pankreatitis: sering terjadi sekitar 1 minggu setelah pembengkakan kelenjar parotis, dengan rasa sakit yang parah dan nyeri tekan serta ketegangan otot di perut bagian atas dan tengah sebagai gejala utama. Hal ini disertai dengan muntah, demam, perut kembung dan sembelit, dan terkadang ditemukan pembesaran pankreas. 4. Meningitis atau meningoensefalitis: Manifestasi klinis meliputi demam tinggi akut dengan sakit kepala parah, muntah, mengantuk atau penurunan kesadaran, tanda-tanda positif iritasi meningeal, dll. Pemeriksaan cairan serebrospinal menunjukkan adanya perubahan pada ensefalitis virus atau meningitis. Prognosis umumnya baik, tetapi beberapa kasus yang parah dapat menyebabkan kematian. 5. Miokarditis: Paling sering terlihat pada 5 hingga 10 hari pertama penyakit. Hal ini ditandai dengan pucat, denyut jantung yang meningkat atau lambat, bunyi jantung yang tumpul, aritmia dan pembesaran jantung sementara. Murmur sistolik. EKG menunjukkan henti sinus, blok atrioventrikular, depresi segmen ST, dan gelombang T yang rendah atau terbalik. Kasus yang parah dapat berakibat fatal. Namun, sebagian besar hanya mengalami perubahan EKG tanpa tanda klinis yang jelas. Kadang-kadang, terjadi perikarditis. 6. Nefritis: Virus gondongan dapat diisolasi dalam urin pada tahap awal, sehingga diperkirakan virus gondongan dapat secara langsung merusak ginjal, dengan sejumlah kecil protein dalam urin pada kasus ringan dan manifestasi yang sama dengan glomerulonefritis akut pada kasus yang parah. Sebagian besar kasus memiliki prognosis yang baik.