Endoskopi kapsul terutama didasarkan pada menelan kapsul, merekam dan memutar ulang pengamatan. Gastroskopi kapsul dapat dilakukan jika terdapat perdarahan saluran cerna yang tidak dapat dijelaskan, dugaan anemia defisiensi besi, tumor usus halus, sering merasa tidak nyaman pada perut, mual, muntah, refluks asam, bersendawa, dan nyeri pada perut. Saluran pencernaan pasien perlu dibersihkan sebelum pemeriksaan, yang pada dasarnya sama dengan persiapan kolonoskopi. Setelah berada di dalam tubuh, endoskopi kapsul akan mengikuti gerakan peristaltik saluran pencernaan sampai ke dalam tubuh, mengambil gambar dengan interval dua detik setiap kali, dan informasi dari gambar yang diambil akan dikirim ke perekam gambar di luar tubuh kapan saja. Dokter akan mengamati dan menganalisis gambar perekam gambar dan dapat membantu pasien untuk menentukan apakah ada penyakit. Setelah 8-72 jam menelan kapsul, endoskopi kapsul akan dikeluarkan dari tubuh bersama feses.