Prosedur pembedahan litotripsi koledokoskopi umumnya meliputi tiga langkah: sayatan saluran empedu atau pengangkatan tabung-T, pencarian batu secara koledokoskopi, dan ekstraksi batu. 1. Sayatan saluran empedu atau pengangkatan tabung-T: Untuk ekstraksi batu koledokoskopi umum, saluran empedu umum perlu ditemukan dan diiris terlebih dahulu dengan laparoskopi. Dalam kasus ekstraksi batu saluran empedu pasca operasi, biasanya dilakukan melalui saluran sinus berserat yang dibentuk oleh tabung T yang telah ditahan sebelumnya, yang perlu ditarik keluar terlebih dahulu. 2. Choledochoscope untuk menemukan batu: Choledochoscope secara perlahan dimasukkan ke dalam saluran empedu, dan gambar pada layar tampilan digunakan untuk mengamati dan mencari batu, serta menentukan lokasi dan distribusi serta ukuran batu. 3. Ekstraksi batu: Setelah menemukan batu, di bawah penglihatan langsung koledoskop, keranjang ekstraksi batu ditempatkan di ujung distal batu, dan batu secara perlahan dikeluarkan setelah membuka keranjang. Prosedur litotripsi koledoskopi hanya membutuhkan tiga langkah seperti yang disebutkan di atas, tetapi konsep asepsis perlu ditekankan. Disarankan untuk melakukan prosedur ini di rumah sakit biasa untuk menghindari komplikasi pasca operasi seperti peritonitis kolestatik.