Penyebab sindrom Down adalah sebagai berikut: pertama, dapat disebabkan oleh kelainan kromosom dan faktor genetik orang tua; kedua, embrio akan dipengaruhi oleh banyak faktor dalam proses tumbuh kembangnya, seperti faktor lingkungan eksternal, faktor makanan, dll. Jika sering terpapar bahan kimia, seperti logam berat, maka dapat menyebabkan kelainan kromosom dan dengan demikian menyebabkan sindrom Down. Faktor ketiga terkait dengan penyakit selama kehamilan, seperti diabetes gestasional dan hipertensi, yang dapat memengaruhi pertumbuhan dan perkembangan janin dan menyebabkan kegagalan atau malformasi embrio, yang juga dapat menyebabkan gejala-gejala tersebut.