Ada beberapa jenis penyebab keterlambatan perkembangan pubertas, sebagai berikut: 1) keterlambatan fisik dalam perkembangan pubertas, di mana anak biasanya memiliki riwayat keluarga yang sesuai; 2) anak-anak dengan pola makan parsial dan asupan makanan berbasis protein yang relatif rendah, yang usia tulangnya ditemukan lebih dari dua tahun lebih lambat dari usia yang sebenarnya, yang merupakan penyebab paling umum; 3) keterlambatan perkembangan pubertas yang disebabkan oleh kondisi penyakit, biasanya kelainan kromosom pada anak perempuan, seperti sindrom Turner Pada anak laki-laki, kelainan kromosom atau sindrom yang terkait juga dapat menyebabkan keterlambatan pubertas, serta obesitas atau hipogonadisme, yang dapat ditentukan melalui tes fisik dan laboratorium.