Penyakit radang pada saluran pencernaan, seperti mukositis usus, ileitis segmental, dan infeksi Helicobacter pylori, merupakan penyebab utama buang air besar yang tidak teratur dan perut kembung yang berlebihan. Karena lesi inflamasi saluran pencernaan pasien, akan menyebabkan munculnya disfungsi fungsional dan ketidakseimbangan proporsi flora bakteri. Ketika makanan memasuki saluran pencernaan, tidak hanya tidak dapat diuraikan dan diserap secara normal, tetapi juga akan mengalami reaksi metabolisme yang berlebihan dengan bakteri berbahaya, menghasilkan sejumlah besar zat gas. Gas dan nutrisi akan masuk ke saluran pencernaan bagian bawah dengan gerakan peristaltik lambung dan usus, yang akan menyebabkan pasien sering buang air besar, peningkatan gas, diare, tinja encer dan gejala lainnya. Namun, tidak menutup kemungkinan adanya penyakit pencernaan non-inflamasi seperti sindrom iritasi usus besar, disbiosis flora usus, dan sindrom malabsorpsi usus kecil.