Jenis pembedahan invasif minimal untuk refluks empedu dan bagaimana pembedahan ini dilakukan, tergantung pada penyebab refluks empedu. Penyebab paling umum dari refluks empedu dalam praktik klinis adalah batu saluran empedu di hati dan saluran empedu. Prosedur invasif minimal ini biasanya dilakukan dengan mengangkat kantung empedu atau mengeluarkan batu dari saluran empedu di dalam dan di luar hati, dan, jika perlu, lobus hati, untuk mencoba mengeluarkan batu dan mencegah refluks. Jika obstruksi empedu dipertimbangkan, stenting invasif minimal atau perawatan ERCP diperlukan untuk meringankan obstruksi saluran empedu bagian bawah. Dalam beberapa kasus, jika keganasan dipertimbangkan, diperlukan pembedahan radikal. Jika refluks empedu dianggap disebabkan oleh esofagus kardia bagian bawah yang tertunda, maka esofagoplasti kardia bagian bawah dapat dipertimbangkan.