Untuk jenis penyakit yang berbeda, angka kematian setelah kraniotomi berbeda. Jika disebabkan oleh cedera otak yang berat, angka kematiannya sangat tinggi dan dapat mencapai 30 persen atau bahkan lebih tinggi. Untuk beberapa pasien dengan pendarahan otak, angka kematian juga sekitar 10% hingga 20%. Angka kematian hanyalah angka statistik untuk tujuan penelitian, dan tidak berarti banyak bagi individu, karena setelah kraniotomi, setiap pasien akan meninggal atau selamat, jadi pada dasarnya kemungkinannya adalah 1/2.