Kolangioskopi biasanya tidak memakan waktu lebih dari 1-2 jam. Kolesangioskopi intraoperatif, di mana pasien dibius total dan beberapa batu lebih banyak, membutuhkan waktu lebih lama untuk diambil. Masing-masing batu diambil dengan baik, beberapa batu dalam keadaan tertanam, dan litotripsi laser digunakan selama operasi. Selain itu, operasi ini terus membilas saluran empedu dengan cairan, dan air mengalir ke luar melalui sayatan. Terlalu banyak waktu dan banyak air yang membilas saluran empedu akan membuat pasien merasa kedinginan. Kolesedokoskopi pasca operasi dilakukan berulang kali melalui saluran sinus, dengan sejumlah besar air yang mengalir setiap kali, kadang-kadang 1000-2000ml sekaligus, sebagian besar airnya 3000-4000ml. koledokoskopi pasca operasi sering kali dilakukan dengan anestesi lokal, dan pasien akan merasakan ketidaknyamanan yang lebih besar jika operasi memakan waktu terlalu lama dan jumlah air melebihi 4000ml. Kolesedokoskopi pasca operasi dapat diulang beberapa kali untuk mengambil batu, dan dapat dilakukan untuk kedua kalinya setelah 5-7 hari jika batu tidak terangkat dalam satu kali koledokoskopi. Karena ini adalah prosedur invasif minimal, maka tidak perlu dilakukan sekaligus, karena dapat menyebabkan lebih banyak rasa sakit pada pasien. Banyak pasien yang merasa takut untuk menjalani koledokoskopi setelah menjalani prosedur ini satu kali. Kolesedoskopi dapat ditoleransi selama satu jam atau lebih dan pasien dapat melanjutkan untuk melakukan koledoskopi lagi di lain waktu. Jika dilakukan terlalu lama, pasien akan mengalami ketakutan yang dapat mengganggu kemampuan pasien untuk melanjutkan prosedur berikutnya.