Yang disebut lesi prakanker bukanlah kanker, tetapi peluang berkembangnya kanker gastrointestinal jauh lebih tinggi dengan penyakit-penyakit ini, dan sebagian pasien akan berkembang menjadi kanker jika penyakit prakanker ini tidak diobati secara aktif. Oleh karena itu, setelah penyakit-penyakit ini didiagnosis, mereka harus ditangani secara positif, dengan tindak lanjut rawat jalan spesialis secara teratur dan intervensi dini. Lesi prakanker kanker lambung meliputi: (1) gastritis atrofi kronis, (2) polip lambung, (3) gastritis residual, (4) anemia pernisiosa dengan atrofi lambung yang signifikan, (5) beberapa tukak lambung; lesi prakanker kanker kolorektal meliputi: (1) kolitis ulseratif kronis, (2) adenoma kolorektal, dan (3) familial adenomatous polyposis. Lesi prakanker gastrointestinal ini biasanya dapat dideteksi dengan gastroskopi, sehingga gastroskopi dini diperlukan untuk gejala-gejala seperti rasa tidak nyaman pada gastrointestinal, kembung, mual, sendawa, darah dalam tinja, diare, konstipasi, penurunan berat badan dan nafsu makan yang buruk. Untuk polip hiperplastik inflamasi, dapat dilakukan tindak lanjut secara teratur, tetapi untuk polip adenomatosa, terutama adenoma vili, polip basal yang lebar dan polip yang lebih besar dari 1 cm, diperlukan pengangkatan endoskopi awal atau gabungan endoskopi dan laparoskopi.