Vaksin biasanya tidak memiliki efek samping jangka panjang, tetapi beberapa orang mungkin mengalami reaksi yang tidak diinginkan seperti alergi, demam, kelelahan, ketidaknyamanan pencernaan atau kemerahan, bengkak, dan kekerasan di tempat suntikan. Selain itu, vaksin telah terbukti aman dan efektif melalui sejumlah besar penelitian dan data eksperimental sebelum digunakan di klinik, sehingga umumnya tidak memiliki efek samping jangka panjang. Vaksin pada dasarnya adalah mikroorganisme patogen seperti virus atau bakteri dan metabolitnya yang dilemahkan dan dinonaktifkan (hampir tidak berpengaruh pada tubuh manusia) untuk merangsang sistem kekebalan tubuh untuk memproduksi antibodi dan zat pelindung lainnya, sehingga ketika patogen tersebut terinfeksi kembali ke dalam tubuh manusia, maka antibodi yang telah diproduksi akan menghasilkan respon imun. Reaksi merugikan jangka pendek seperti demam, kelelahan, alergi, serta bengkak dan nyeri di tempat suntikan dapat terjadi pada beberapa orang setelah vaksinasi, dan hal ini merupakan hal yang normal. Vaksin hanya memiliki arti penting dalam mencegah penyakit jika manfaatnya lebih besar daripada bahaya bagi tubuh manusia, jadi tidak perlu terlalu cemas, jika Anda memenuhi persyaratan vaksinasi, vaksinasi normal dapat memberikan efek perlindungan pada tingkat tertentu.