Cacat septum atrium tipe 2 mengacu pada cacat septum foraminal sekunder, yang terletak di fossa ovalis dan disebabkan oleh terhambatnya perkembangan septum sekunder atau penyerapan septum primer yang berlebihan. Jika dasar foramen ovale adalah tipe foramen ovale, maka akan terlihat beberapa cacat, dengan berbagai ukuran cacat, mulai dari kurang dari 3 mm hingga lebih dari 20 mm. Pasien yang berusia lebih muda dan memiliki defek berdiameter kurang dari 7-8 mm dapat mengalami penutupan spontan atau defek yang lebih kecil, sedangkan pasien dengan defek septum atrium berukuran sedang hingga besar cenderung tidak dapat menutup secara spontan dan dapat bergejala sebelum usia 40 tahun. Diagnosis defek septum foramen ovale sekunder dapat dipastikan melalui ekokardiografi dinding dada, dan pasien yang tidak dapat menutup secara spontan harus diobati dengan pembedahan secepatnya. Diagnosis dapat dipastikan dengan ekokardiografi dinding dada.