Meskipun ada kemajuan dalam terapi medis, sekitar 70-80% pasien dengan penyakit Crohn (selanjutnya disebut sebagai CD) akan memerlukan pembedahan selama masa hidup mereka. Namun demikian, pembedahan tidak menyembuhkan CD dan kekambuhan CD setelah pembedahan sangat umum terjadi; oleh karena itu, pada pasien dengan CD, pembedahan biasanya dilakukan untuk meringankan gejala yang memburuk atau untuk mengatasi komplikasi akut, sementara mempertahankan fungsi usus perlu dipertimbangkan. Penanganan bedah CD usus halus dan CD tipe ileocecal didefinisikan secara jelas sebagai membutuhkan intervensi bedah dengan lokasi lesi yang berbeda, mempertahankan sebanyak mungkin segmen usus normal. Ileum terminal dan sekum adalah dua tempat yang paling rentan, yang mengakibatkan perlunya pembedahan pada sekitar 40% pasien. Pasien dengan penyakit ileokolik memiliki probabilitas 75% untuk dioperasi dalam waktu 5 tahun setelah onset, dibandingkan dengan 90% pada 10 tahun. Pembedahan tipe ileocecal terbatas pada pengangkatan bagian ileocecal, dan penelitian telah mengkonfirmasi komplikasi yang sebanding dan tingkat mortalitas antara pembedahan laparoskopi dan terbuka. Tingkat operasi ulang pada 5 dan 10 tahun setelah operasi pertama masing-masing 20% dan 35%. Sekitar 10-20% pasien memiliki tipe usus kecil (lesi yang hanya melibatkan jejunum) dan pengobatan medis konservatif belum efektif pada pasien ini. Beberapa pasien dapat berkembang menjadi stenosis fibrotik, ketika pilihan stenoplasti usus kecil dapat sangat mengurangi kemungkinan pasien akhirnya mengembangkan sindrom usus pendek. Prosedur ini aman dan tidak meningkatkan risiko kekambuhan setelah pembedahan. Dilatasi endoskopik dari striktur kolon atau ileokolonik saat ini sedang dilakukan di beberapa pusat medis di luar negeri dan pengobatan ini memiliki potensi untuk menunda operasi awal pada beberapa pasien. Terus merokok setelah pembedahan dapat meningkatkan risiko kekambuhan. CD kolon CD kolon menyumbang sekitar 20-30% dari keseluruhan CD. Pasien-pasien ini mencapai sekitar 25% dari semua pasien yang telah menjalani reseksi usus besar. Beberapa pendekatan bedah digunakan pada CD kolon, tetapi tingkat reseksi masih menjadi perdebatan. Meta-analisis baru-baru ini yang membandingkan reseksi segmental dan sub-total untuk CD kolon dalam 6 studi yang diterbitkan dari 488 pasien melaporkan bahwa tingkat kekambuhan untuk reseksi segmental adalah 25-72%, dengan tingkat kekambuhan kumulatif 10 tahun sebesar 66%. Sebaliknya, tingkat operasi ulang kumulatif 10 tahun setelah kolektomi total dengan anastomosis ileorektal adalah 37-74%. Sebagian besar penelitian melaporkan lesi perianal sebagai faktor risiko kekambuhan bedah. Pada pasien yang hanya melibatkan segmen pendek usus, reseksi segmental lebih menguntungkan. Bagi mereka yang memiliki keterlibatan distal yang menyebar dan lesi perianal bersamaan yang berisiko tinggi mengalami kekambuhan pasca operasi, kolektomi total yang agresif harus dianjurkan.