Gejala umum termasuk demam, sakit kepala, muntah, tonisitas leher, kejang-kejang, afasia, hemiparesis, ataksia, gerakan tak disengaja, gangguan kejiwaan, gangguan kesadaran, dan tanda-tanda iritasi meningeal. Pasien dengan ensefalitis menunjukkan kerusakan parenkim otak yang menonjol dan rentan terhadap kejang-kejang, afasia, hemiparesis, gangguan mental dan intelektual. Beberapa infeksi lentiviral ensefalitis didominasi oleh kelainan mental, yang bermanifestasi sebagai kurangnya perhatian, perilaku aneh, tidak responsif, berkurangnya kemampuan berbicara, ketidakpedulian emosional, secara bertahap berkembang menjadi bisu, keadaan bisu, ketidakmampuan untuk merawat diri sendiri, dan istirahat di tempat tidur. Sakit kepala, muntah, tonisitas serviks dan iritasi meningeal lebih menonjol pada pasien dengan meningitis, dan manifestasi kerusakan otak fokal sering terlihat pada tahap selanjutnya.