HBV adalah virus DNA hepatofilik dengan panjang genom sekitar 3,2 kb dan sebagian merupakan DNA siklik untai ganda. HBV tahan, tetapi HBV dapat dinonaktifkan dengan merebus pada suhu 65 ° C selama 10 jam, merebus selama 10 menit atau uap tekanan tinggi. etilen oksida, glutaraldehida, asam peroksiasetat dan iodoform juga memiliki efek inaktivasi yang baik pada HBV. Setelah HBV menyerang hepatosit, bagian dari DNA HBV siklik untai ganda digunakan dalam nukleus untuk memperpanjang rantai positif dengan DNA untai negatif sebagai templat untuk memperbaiki area sumbing dalam rantai positif, membentuk DNA loop tertutup kovalen (cccDNA); kemudian cccDNA digunakan sebagai templat untuk ditranskripsi menjadi beberapa mRNA dengan panjang yang berbeda, yang digunakan sebagai RNA pregenomik dan menyandikan berbagai antigen HBV. (cccDNA memiliki waktu paruh yang panjang dan sulit untuk sepenuhnya dihilangkan dari tubuh. HBV telah ditemukan memiliki 9 genotipe, A-I, dengan tipe C dan B yang mendominasi di Cina. Genotipe HBV dikaitkan dengan perkembangan penyakit dan efektivitas terapi interferon alfa. Dibandingkan dengan mereka yang terinfeksi genotipe C, mereka yang terinfeksi genotipe B menunjukkan konversi serologis HBeAg lebih awal dan lebih sedikit berkembang menjadi hepatitis kronis, sirosis, dan karsinoma hepatoseluler primer.