Pada prinsipnya, transplantasi usus halus harus dipertimbangkan untuk kegagalan usus yang tidak dapat disembuhkan ketika nutrisi parenteral total (TPN) gagal mempertahankan kehidupan atau ketika terjadi komplikasi yang mengancam jiwa. Berdasarkan penyakit yang mendasari yang berbeda pada pasien yang berbeda, transplantasi usus halus dibagi ke dalam tiga jenis pembedahan: transplantasi usus halus sederhana, transplantasi gabungan hati-usus halus, dan transplantasi gabungan multi-organ. Transplantasi usus halus sederhana: (1) Sindrom usus pendek: peradangan usus halus nekrosis, atresia usus halus, torsio usus halus, fisura abdomen, cacat pada abdomen, penyakit Crohn, emboli atau trombosis pembuluh darah mesenterika; (2) Cacat pada dinamika usus halus: miopati atau neuropati pada organ gua, dan tidak adanya ganglion pada seluruh usus halus; (3) Gangguan daya serap sel usus halus: penyakit inklusi mikrovili, enteropati autoimun selektif, radang usus akibat radiasi, dan penyakit radang usus akibat radiasi; (4) Penyakit usus inflamasi: penyakit usus akibat radiasi, penyakit radang usus akibat radiasi, penyakit radang usus akibat radiasi, penyakit radang usus akibat radiasi. penyakit radang usus; (4) Tumor saluran cerna: sindrom Gardner, sklerofibroma mesenterika, poliposis usus halus. Transplantasi gabungan hati-usus halus: (1) Untuk kasus gagal usus yang tidak dapat disembuhkan yang dikombinasikan dengan gagal hati yang tidak dapat disembuhkan. Gagal hati sering kali merupakan akibat sekunder dari pemberian nutrisi parenteral total (TPN) jangka panjang pada pasien gagal usus kecil. (2) Transplantasi gabungan hati-usus halus juga diindikasikan pada kasus gagal hati yang dikombinasikan dengan trombosis vena porta dan vena mesenterika superior. *Untuk pasien yang mengalami hiperkoagulasi dengan fungsi hati normal, vena limpa paten, dan trombosis luas pada vena mesenterika superior, transplantasi usus halus saja dapat dilakukan dengan segera, tetapi antikoagulan oral seumur hidup diperlukan setelah operasi. Transplantasi kombinasi multi organ: Kegagalan beberapa organ perut (termasuk usus halus) atau keterlibatan tumor pada beberapa organ perut memerlukan transplantasi kombinasi multi organ. Transplantasi multiseluler lengkap meliputi transplantasi blok hati, lambung, duodenum, pankreas, dan seluruh usus halus, dan transplantasi multiseluler yang dimodifikasi adalah transplantasi blok organ selain hati.