Hepatitis kronis dan sirosis 100-200 kali lebih mungkin mengembangkan kanker hati daripada yang lain. Methemoglobin saat ini merupakan salah satu tes serologis yang paling spesifik dan sensitif untuk diagnosis kanker hati. Pada pasien dengan karsinoma hepatoseluler, sekitar 50% – 80% kadar fetoprotein serum berada di atas 300 μg/L, yang merupakan salah satu indikator diagnostik awal karsinoma hepatoseluler primer. Pemeriksaan ulang fetoprotein secara teratur pada pasien dengan hepatitis kronis dan sirosis dapat membantu dalam deteksi dini kanker hati untuk pengobatan tepat waktu. Naik turunnya alfa-fetoprotein dapat digunakan sebagai indikator untuk menilai prognosis kanker hati atau untuk mengamati efek pembedahan dan berbagai pengobatan anti-kanker: setelah reseksi pembedahan atau berbagai tindakan pengobatan diambil setelah diagnosis kanker hati, penurunan alfa-fetoprotein yang signifikan menunjukkan bahwa pengobatan tersebut efektif; jika meningkat lagi setelah penurunan tersebut, hal ini menunjukkan bahwa kanker hati memiliki tanda-tanda kekambuhan dan metastasis. Pada beberapa penyakit hati jinak seperti hepatitis akut, hepatitis kronis dan sirosis, ketika peradangan hati aktif, hepatosit sedang dalam proses kerusakan, perbaikan dan regenerasi, dan alfa-fetoprotein akan meningkat, tetapi konsentrasinya biasanya tidak terlalu tinggi, sebagian besar di bawah 200μg/L. Saat hepatitis membaik, alfa-fetoprotein akan turun dan secara bertahap kembali normal. Ini adalah indikator yang baik untuk memantau karsinoma hepatoseluler, terutama untuk diagnosis dini karsinoma hepatoseluler kecil, tetapi praktik klinisnya kompleks dan bervariasi. Tidaklah tepat untuk membuat diagnosis karsinoma hepatoseluler berdasarkan peningkatan alfa-fetoprotein saja. Diagnosis yang benar hanya dapat dibuat setelah analisis komprehensif riwayat medis, gejala, dan berbagai data laboratorium dan pencitraan.