Kanker ginjal juga dapat salah didiagnosis, karena cara utama untuk mendiagnosis kanker ginjal saat ini bergantung pada tes pencitraan seperti CT (computed tomography) dan MRI (magnetic resonance imaging), yang biasanya memiliki hasil diagnostik sekitar 90% dan masih menyisakan sekitar 10% pasien dengan situs ginjal yang menempati tanpa kejelasan mengenai sifat pastinya. Kanker ginjal perlu dibedakan dari kondisi-kondisi ini
Kista ginjal
Kista ginjal adalah jenis lesi ginjal yang paling umum dan kista sederhana adalah kondisi jinak. Namun demikian, dalam kasus penebalan dinding kista yang tidak teratur, atau pendarahan di dalam kista, atau pemisahan dinding kista, hal ini perlu ditanggapi secara serius dan pemeriksaan CT atau magnetic resonance imaging (MRI) lebih lanjut diperlukan untuk menyingkirkan kanker ginjal kistik.
Tumor malformasi ginjal
Keganasan ginjal, juga dikenal sebagai angiosarkoma, adalah tumor jinak yang relatif umum. Kadang-kadang tumor ganas ginjal atipikal dengan lemak yang sangat sedikit sulit dibedakan dari kanker ginjal dan sering kali memerlukan CT dan MRI lebih lanjut, dan dalam beberapa kasus, pemeriksaan patologis setelah pembedahan adalah satu-satunya cara untuk membedakannya dari kanker ginjal.
Abses ginjal
Pasien dengan abses ginjal memiliki gejala infeksi dan demam, sering kali dengan urin bernanah dan jumlah darah yang tinggi, dan perlu diidentifikasi dengan kultur bakteri dan tes tusukan.
Limfoma ginjal
Kurang umum, kurang spesifik pada pencitraan, sebagian besar nodular atau difus yang menginfiltrasi seluruh ginjal, dengan penampilan ginjal yang membesar secara nyata, seringkali dengan infiltrasi kelenjar getah bening retroperitoneal, dan sebagian besar manifestasi limfoma sistemik yang terlokalisasi.
Granuloma kuning ginjal
Juga sangat jarang, ini adalah jenis infeksi kronis spesifik pada parenkim ginjal.
Karsinoma pelvis ginjal
Tumor ini merupakan tumor ganas yang timbul pada mukosa pelvis ginjal dan kaliks. Tumor ini cenderung muncul dengan hematuria pada tahap awal dan dapat dideteksi dengan CT atau CTU (CT urografi) sebagai lesi yang menempati pelvis ginjal atau sebagai defek pengisian yang signifikan, sering kali dengan sitologi eksfoliatif urin yang positif atau tes protein matriks urin.