Ada banyak alasan untuk ketidaknyamanan perut, sebagian besar pasien rentan terhadap ketidaknyamanan perut setelah makan karena makan terlalu cepat, makan terlalu banyak makanan pedas, merangsang dan tidak dapat dicerna. Jika tubuh mengalami ketidaknyamanan perut dalam kondisi stres, hal ini terutama dianggap disebabkan oleh kram perut. Ada dua jenis saraf utama yang mengatur perut, yang satu simpatik dan yang lainnya vegetatif. Ketegangan emosional dan stres dapat menyebabkan saraf simpatik menjadi bergairah, sehingga mengakibatkan kontraksi berlebihan pada saluran pencernaan dan gerakan perut yang tidak terkoordinasi, yang dapat menyebabkan kram perut. Motilitas gastrointestinal yang tidak terkoordinasi juga dapat menyebabkan gejala klinis pada pasien, umumnya nyeri perut, mual dan muntah. Hal ini khususnya terlihat pada pasien dengan gangguan lambung seperti sinusitis erosif, refluks gastro-esofagus dan tukak lambung.